Laboratorio di Parassitologia molecolare

Responsabili: Prof. Davide Sassera, Dr. Michele Castelli

Collaboratori: Umberto Postiglione (borsista), Gherard Batisti Biffignandi (dottorando), Tiago Nardi (dottorando), Greta Bellinzona (dottoranda), Beatrice Bisaglia (dottoranda), Emanuela Clementi (tecnico)

Le attività di ricerca del gruppo di Parassitologia molecolare sono focalizzate sullo studio delle interazioni fra organismi di specie diverse, a carattere mutualistico, commensalistico o parassitico. Ci si propone di caratterizzare tali sistemi da un punto di vista funzionale ed evolutivo, nonché di fornire basi interpretative utili a prevenzione e trattamento delle infezioni di rilevanza medica/veterinaria. Tali studi si avvalgono di un approccio integrato, incluse tecniche sperimentali e analitiche quali genomica, trascrittomica, machine learning, biologia molecolare, microscopia ottica ed elettronica. Le principali linee di ricerca, suddivise in due aree tematiche principali, sono riportate di seguito.

Analisi evolutive integrate su batteri simbionti

-origine evolutiva, dinamiche e meccanismi molecolari-cellulari coinvolti nella simbiosi del batterio Midichloria con zecche Ixodidae e in particolare per la localizzazione all’interno dei mitocondri

-origine e differenziazione evolutiva delle associazioni intracellulari fra batteri ed eucarioti, con particolare riferimento all’ordine delle Rickettsiales (Alphaproteobacteria)

-origine ed evoluzione delle simbiosi mutualistiche nutrizionali fra batteri e artropodi, quali zecche e cimici

Analisi “omiche” su patogeni e parassiti

-Sviluppo e utilizzo di metodi innovativi per il monitoraggio di artropodi vettori, quali tecniche di screening molecolare, environmental DNA, metagenomica, metatrascrittomica e modellistica ecologica e multi-omica

-epidemiologia genomica di organismi patogeni/parassiti procarioti (e.g. Klebsiella, Staphylococcus, Listeria) ed eucarioti (e.g. Candida, Cryptosporidium), finalizzata alla ricostruzione di outbreak e alle analisi evolutive di virulenza e resistenza

-sviluppo di modelli predittivi e pipeline bioinformatiche per la genomica batterica, in particolare per la predizione di determinanti di resistenze antibiotiche, ricostruzione di eventi epidemici e plasticità genomica nell’acquisizione di fattori di resistenza e virulenza