Laboratorio di Parassitologia molecolare

Responsabili: Prof. Davide Sassera

Collaboratori: Gherard Batisti Biffignandi (collaboratore), Greta Bellinzona (assegnista di ricerca), Sophie Melis (dottoranda), Carlo Croci (dottorando), Michela Vumbaca (dottoranda), Luca Erriquez (dottorando), Emanuela Clementi (tecnico), Adriana Vendramin (borsista), Laura Mottarlini (borsista)

Le attività di ricerca del gruppo di Parassitologia molecolare sono focalizzate sullo
studio delle interazioni fra organismi di specie diverse, a carattere mutualistico,
commensalistico o parassitico. Ci si propone di caratterizzare tali sistemi da un
punto di vista funzionale ed evolutivo, nonché di fornire basi interpretative utili a
prevenzione e trattamento delle infezioni di rilevanza medica/veterinaria. Tali studi si
avvalgono di un approccio integrato, incluse tecniche sperimentali e analitiche quali
genomica, trascrittomica, bioinformatica (machine learning, protein structure
prediction…), biologia molecolare, microscopia ottica ed elettronica. Le principali
linee di ricerca, suddivise in due aree tematiche principali, sono riportate di seguito.

Analisi “omiche” su patogeni e parassiti

• Sviluppo e utilizzo di metodi innovativi per il monitoraggio di artropodi vettori
  (zecche in primis), quali tecniche di screening molecolare, environmental DNA,
  metagenomica, population genomics
• epidemiologia genomica di organismi patogeni/parassiti, sia procarioti (e.g.
  Borrelia, Klebsiella) che eucarioti (e.g. Candida, Cryptosporidium), finalizzata alla
  ricostruzione di outbreak e alle analisi evolutive su fattori di virulenza e resistenza

sviluppo di modelli predittivi e pipeline bioinformatiche per la genomica batterica, in
particolare per la predizione di determinanti di resistenze antibiotiche, ricostruzione
di eventi epidemici e plasticità genomica nell’acquisizione di fattori di resistenza e
virulenza

Analisi evolutive integrate su batteri simbionti

• origine evolutiva, dinamiche e meccanismi molecolari-cellulari coinvolti nella
  simbiosi del batterio Midichloria con zecche Ixodidae e in particolare per la
  localizzazione all’interno dei mitocondri
• origine e differenziazione evolutiva delle associazioni intracellulari fra batteri ed
  eucarioti, con particolare riferimento all’ordine delle Rickettsiales
  (Alphaproteobacteria)
• origine ed evoluzione delle simbiosi mutualistiche nutrizionali fra batteri e artropodi,
  quali zecche e acari